Τα συγκεκριμένα στελέχη επιλέγονται κατάλληλα ώστε μετατρέπουν μεγαλύτερο μέρος του οργανικού υποστρώματος που τους διατίθεται σε CO2 και νερό, ενώ μικρότερο τμήμα ενσωματώνεται σε κύτταρα νέας βιομάζας, συγκριτικά με τυπικά ετερότροφα βακτήρια που κυριαρχούν σε συμβατικά συστήματα ενεργού ιλύος. Τα μικροθρεπτικά που περιέχει το προϊόν διεγείρουν τη βιολογική δραστηριότητα στο εσωτερικό των φλόκων ιλύος, όπου η διείσδυση του οξυγόνου είναι περιορισμένη ώστε διαμορφώνονται τοπικά ανοξικές/αναερόβιες συνθήκες, με αποτέλεσμα, επίσης, την αποικοδόμηση του οργανικού φορτίου με μειωμένη παραγωγή παραπροϊόντων βιομάζας, καθώς ο αναερόβιος/ανοξικός μεταβολισμός χαρακτηρίζεται από μειωμένο συντελεστή απόδοσης βιομάζας (biomass yield) σε σύγκριση με τον αερόβιο. Επίσης, εξαιτίας του δυναμικού υδρολυτικών ενζύμων που χαρακτηρίζει το προϊόν βιοενίσχυσης, ένα μεγαλύτερο μέρος των δύσκολα βιοδιασπάσιμων στερεών που περιέχονται στα λύματα και που υπό διαφορετικές συνθήκες θα απομακρυνόταν, χωρίς να υποστούν κάποια μετατροπή, με το ρεύμα της πρωτοβάθμιας ή δευτεροβάθμιας λάσπης, με την εφαρμογή της τεχνολογίας βιοενίσχυσης καθίσταται εφικτή η μερική ή ολική υδρόλυσή τους, με αποτέλεσμα να καθίσταται προσβάσιμα σε βιολογική αποικοδόμηση, ώστε μόνο ένα τμήμα τους να μετατρέπεται τελικά σε βιοστερεά, ενώ το μεγαλύτερο να οξειδώνεται. Τέλος, εξαιτίας του είδους μεταβολισμού των μικροοργανισμών (προαιρετικά αναερόβιοι), έχουν την ικανότητα δράσης σε συνθήκες έλλειψης οξυγόνου (αναερόβιες και ανοξικές), ώστε καθίσταται εφικτή η διαμόρφωση ή/και επιμήκυνση της διάρκειας λειτουργικών φάσεων χωρίς εφαρμογή αερισμού στο βιολογικό αντιδραστήρα, με αποτέλεσμα σημαντικά ενεργειακά οφέλη